Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
L1TD1Q5T7N2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
L1TD1Q5T7N2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
L1TD1Q5T7N2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
L1TD1Q5T7N2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
L1TD1Q5T7N2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
L1TD1Q5T7N2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
L1TD1Q5T7N2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
L1TD1Q5T7N2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
L1TD1Q5T7N2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
L1TD1Q5T7N2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
L1TD1Q5T7N2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
L1TD1Q5T7N2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
L1TD1Q5T7N2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
L1TD1Q5T7N2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
L1TD1Q5T7N2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
L1TD1Q5T7N2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
L1TD1Q5T7N2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms