Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XKR3Q5GH77 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 945.8 ms