Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CDCA8Q53HL2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDCA8Q53HL2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.14■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms