Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIDA1Q1XH10 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms