Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1DQ13901 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1DQ13901 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
C1DQ13901 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1DQ13901 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1DQ13901 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1DQ13901 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C1DQ13901 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1DQ13901 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1DQ13901 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C1DQ13901 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C1DQ13901 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C1DQ13901 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1DQ13901 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1DQ13901 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C1DQ13901 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1DQ13901 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
C1DQ13901 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C1DQ13901 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1DQ13901 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1DQ13901 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1DQ13901 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C1DQ13901 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1DQ13901 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1DQ13901 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C1DQ13901 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C1DQ13901 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C1DQ13901 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1DQ13901 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1DQ13901 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C1DQ13901 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C1DQ13901 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1DQ13901 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1DQ13901 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1DQ13901 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1DQ13901 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1DQ13901 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1DQ13901 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1DQ13901 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C1DQ13901 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1DQ13901 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1DQ13901 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1DQ13901 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1DQ13901 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1DQ13901 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1DQ13901 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1DQ13901 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1DQ13901 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1DQ13901 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1DQ13901 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1DQ13901 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1DQ13901 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1DQ13901 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1DQ13901 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1DQ13901 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1DQ13901 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1DQ13901 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1DQ13901 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C1DQ13901 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1DQ13901 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1DQ13901 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1DQ13901 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1DQ13901 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1DQ13901 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1DQ13901 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C1DQ13901 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C1DQ13901 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1DQ13901 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1DQ13901 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C1DQ13901 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1DQ13901 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1DQ13901 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1DQ13901 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1DQ13901 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1DQ13901 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1DQ13901 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1DQ13901 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1DQ13901 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1DQ13901 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C1DQ13901 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1DQ13901 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1DQ13901 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1DQ13901 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1DQ13901 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1DQ13901 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1DQ13901 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1DQ13901 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1DQ13901 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C1DQ13901 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1DQ13901 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1DQ13901 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1DQ13901 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1DQ13901 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1DQ13901 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1DQ13901 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1DQ13901 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1DQ13901 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1DQ13901 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1DQ13901 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1DQ13901 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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