Protein–RNA interactions for Protein: Q13065

GAGE1, G antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAGE1Q13065 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GAGE1Q13065 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GAGE1Q13065 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms