Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.093e-8■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 CUL7-201ENST00000265348 5254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.483e-8■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 ALOX12-AS1-205ENST00000572385 576 ntTSL 413.17□□□□□ -0.33e-6■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 ALOX12-AS1-203ENST00000570562 567 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.63e-6■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 ALOX12-AS1-209ENST00000575889 439 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.683e-6■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 WAC-212ENST00000448193 506 ntTSL 226.58■■□□□ 1.857e-21■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.464e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 ACSS2-216ENST00000484354 517 ntTSL 522.7■■□□□ 1.222e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 TAF1B-206ENST00000469895 681 ntTSL 322.1■■□□□ 1.132e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 ACSS2-205ENST00000467019 504 ntTSL 421.4■■□□□ 1.022e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 ACSS2-213ENST00000480978 844 ntTSL 220.74■□□□□ 0.912e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 ACSS2-222ENST00000493805 603 ntTSL 419.81■□□□□ 0.762e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 ACSS2-208ENST00000473172 665 ntTSL 319.46■□□□□ 0.712e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.662e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.652e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 WAC-211ENST00000442148 759 ntTSL 519.1■□□□□ 0.657e-21■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 NOB1-204ENST00000563055 485 ntTSL 418.94■□□□□ 0.622e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.567e-21■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 NOB1-203ENST00000562416 556 ntTSL 218.51■□□□□ 0.552e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 ACSS2-211ENST00000477932 2450 ntTSL 518.45■□□□□ 0.542e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 ACSS2-210ENST00000476922 1527 ntTSL 218.31■□□□□ 0.522e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 RNF123-204ENST00000443204 481 ntTSL 417.63■□□□□ 0.412e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.392e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 SPIRE2-210ENST00000569108 2409 ntTSL 1 (best)17.21■□□□□ 0.352e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 RNF123-206ENST00000454491 531 ntTSL 417.13■□□□□ 0.332e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.292e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.247e-21■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 NOB1-206ENST00000569871 845 ntTSL 516.46■□□□□ 0.232e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.22e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.172e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.162e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.142e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.112e-12■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 NOB1-205ENST00000564620 812 ntTSL 215.7■□□□□ 0.12e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.092e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 TRMT61B-203ENST00000439947 1584 ntTSL 515.32■□□□□ 0.042e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.044e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.041e-8■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 TAF1B-207ENST00000480197 554 ntTSL 415.19■□□□□ 0.022e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 NOB1-202ENST00000561677 582 ntTSL 215.1■□□□□ 0.012e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.067e-21■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.122e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 DLGAP4-214ENST00000491207 469 ntTSL 414.11□□□□□ -0.152e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.172e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 ACSS2-215ENST00000481971 570 ntTSL 413.96□□□□□ -0.172e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.182e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 WAC-207ENST00000420266 784 ntTSL 513.78□□□□□ -0.27e-21■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 PECR-203ENST00000461330 812 ntTSL 213.74□□□□□ -0.212e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.222e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.222e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 RNF123-210ENST00000487805 5882 ntTSL 213.42□□□□□ -0.262e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 ACSS2-212ENST00000480274 567 ntTSL 513.38□□□□□ -0.272e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.282e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.282e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.282e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 DLGAP4-211ENST00000482037 603 ntTSL 513.1□□□□□ -0.312e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 ACSS2-209ENST00000475459 558 ntTSL 412.83□□□□□ -0.362e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 DLGAP4-212ENST00000482872 839 ntTSL 512.69□□□□□ -0.382e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.382e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 TRMT61B-201ENST00000306108 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.412e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 DLGAP4-209ENST00000479220 577 ntTSL 312.47□□□□□ -0.412e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.422e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 WAC-204ENST00000375646 2176 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.487e-21■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 RNF123-209ENST00000486102 4564 ntTSL 1 (best)11.47□□□□□ -0.572e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 PDK1-201ENST00000282077 14193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.584e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 STAT3-213ENST00000588969 2772 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.582e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 PRRC2C-208ENST00000476522 1931 ntTSL 511.3□□□□□ -0.62e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 DLGAP4-203ENST00000373907 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.622e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 DLGAP4-215ENST00000495241 794 ntTSL 211.08□□□□□ -0.642e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 RSBN1-206ENST00000616024 2703 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.662e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 STAT3-211ENST00000585517 3319 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.712e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 TMCC1-205ENST00000505616 402 ntTSL 210.35□□□□□ -0.752e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 RNF123-207ENST00000457726 4506 ntTSL 1 (best)10.1□□□□□ -0.792e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 RNF123-201ENST00000327697 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.792e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 ACSS2-224ENST00000497927 580 ntTSL 410.04□□□□□ -0.82e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 ACSS2-217ENST00000488172 648 ntTSL 410.04□□□□□ -0.82e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 TAF1B-202ENST00000402170 715 ntTSL 59.72□□□□□ -0.852e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 FAF1-201ENST00000371778 1643 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.861e-8■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 RSBN1-203ENST00000476412 3772 ntTSL 29.6□□□□□ -0.872e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 TMCC1-201ENST00000393238 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.892e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 TTC1-205ENST00000522793 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.892e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 TTC1-201ENST00000231238 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.92e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 ACSS2-214ENST00000481284 2851 ntTSL 29.25□□□□□ -0.932e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 PRRC2C-206ENST00000467601 717 ntTSL 29.25□□□□□ -0.932e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 PRRC2C-203ENST00000392078 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.972e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 TMCC1-202ENST00000426664 5484 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.032e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 COBLL1-221ENST00000493868 6332 ntTSL 1 (best)8.37□□□□□ -1.076e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 TAF1B-205ENST00000434858 1592 ntTSL 28.01□□□□□ -1.132e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 PDK1-209ENST00000466437 599 ntTSL 47.93□□□□□ -1.144e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 COBLL1-214ENST00000460238 580 ntTSL 27.37□□□□□ -1.236e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.252e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 ACSS2-204ENST00000464399 358 ntTSL 56.55□□□□□ -1.362e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.532e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.617e-21■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 WAC-208ENST00000424454 1330 ntTSL 24.97□□□□□ -1.617e-21■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 WAC-210ENST00000439676 2762 ntTSL 54.57□□□□□ -1.687e-21■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 DNAJC9-203ENST00000469143 362 ntTSL 34.45□□□□□ -1.72e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 WAC-201ENST00000345541 4526 ntTSL 1 (best)4.27□□□□□ -1.737e-21■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.757e-21■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.782e-7■■■■□ 25.7
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