Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	CUE2	YKL090W	1332 nt		5.14	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	DED81	YHR019C	1665 nt		5.14	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	SIF2	YBR103W	1608 nt		5.13	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	GEP3	YOR205C	1671 nt		5.13	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	PAN6	YIL145C	930 nt		5.13	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	YOR024W	YOR024W	324 nt		5.13	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	SHE10	YGL228W	1734 nt		5.13	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	MPP10	YJR002W	1782 nt		5.13	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	EEB1	YPL095C	1371 nt		5.13	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	STE20	YHL007C	2820 nt		5.13	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	CLF1	YLR117C	2064 nt		5.12	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	QDR1	YIL120W	1692 nt		5.12	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	MHF2	YDL160C-A	243 nt		5.12	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	ORM1	YGR038W	669 nt		5.12	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	ISU2	YOR226C	471 nt		5.12	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	SEC9	YGR009C	1956 nt		5.12	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	SHM1	YBR263W	1473 nt		5.12	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	RCK1	YGL158W	1539 nt		5.12	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	YFL034W	YFL034W	3222 nt		5.11	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	APL6	YGR261C	2430 nt		5.11	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	LUC7	YDL087C	786 nt		5.11	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	AUA1	YFL010W-A	285 nt		5.11	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	ZRT2	YLR130C	1269 nt		5.11	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	REC114	YMR133W	1287 nt		5.11	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	RPS19B	YNL302C	435 nt		5.11	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	MRP21	YBL090W	534 nt		5.11	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	GPM3	YOL056W	912 nt		5.11	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	ENV7	YPL236C	1095 nt		5.11	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	YCR047W-A	YCR047W-A	207 nt		5.1	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	YDR401W	YDR401W	564 nt		5.1	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	DFM1	YDR411C	1026 nt		5.1	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	ARN1	YHL040C	1884 nt		5.1	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	ATG17	YLR423C	1254 nt		5.1	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	YMR135W-A	YMR135W-A	534 nt		5.1	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	RPA49	YNL248C	1248 nt		5.1	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	KIP2	YPL155C	2121 nt		5.1	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	TPS3	YMR261C	3165 nt		5.1	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	ATH1	YPR026W	3636 nt		5.09	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	ENP1	YBR247C	1452 nt		5.09	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	PRO2	YOR323C	1371 nt		5.09	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	FYV1	YDR024W	486 nt		5.09	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	PRS2	YER099C	957 nt		5.09	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	NPY1	YGL067W	1155 nt		5.09	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	RPL28	YGL103W	450 nt		5.09	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	PIN2	YOR104W	849 nt		5.09	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	ARB1	YER036C	1833 nt		5.09	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	PUF3	YLL013C	2640 nt		5.09	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	QRI1	YDL103C	1434 nt		5.08	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	RPT1	YKL145W	1404 nt		5.08	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	YDR154C	YDR154C	351 nt		5.08	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	SUA5	YGL169W	1281 nt		5.08	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	ECT1	YGR007W	972 nt		5.08	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	FUM1	YPL262W	1467 nt		5.07	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	BLM10	YFL007W	6432 nt		5.07	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	SCO1	YBR037C	888 nt		5.07	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	SEC13	YLR208W	894 nt		5.06	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	ECM19	YLR390W	339 nt		5.06	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	AIM17	YHL021C	1398 nt		5.05	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	HPC2	YBR215W	1878 nt		5.05	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	TFC7	YOR110W	1308 nt		5.05	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	YGR125W	YGR125W	3111 nt		5.05	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	GRE1	YPL223C	507 nt		5.05	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	snR17b	snR17b	332 nt		5.05	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	TOS3	YGL179C	1683 nt		5.05	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	FHL1	YPR104C	2811 nt		5.05	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	HXT14	YNL318C	1623 nt		5.05	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	ULA1	YPL003W	1389 nt		5.04	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	PAP1	YKR002W	1707 nt		5.04	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	YHR193C-A	YHR193C-A	375 nt		5.04	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	SPO7	YAL009W	780 nt		5.04	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	YLR126C	YLR126C	756 nt		5.04	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	CDC28	YBR160W	897 nt		5.04	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	SEG2	YKL105C	3399 nt		5.04	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	AXL2	YIL140W	2472 nt		5.03	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	YJL206C	YJL206C	2277 nt		5.03	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	COX26	YDR119W-A	201 nt		5.03	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	CRT10	YOL063C	2874 nt		5.03	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	ASK10	YGR097W	3441 nt		5.03	□□□□□ -1.6
VIK1	Q12045	NPL6	YMR091C	1308 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	RSC6	YCR052W	1452 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	PMA1	YGL008C	2757 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	MSC7	YHR039C	1935 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	YDL144C	YDL144C	1071 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	tN(GUU)C	tN(GUU)C	74 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	tN(GUU)F	tN(GUU)F	74 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	tN(GUU)G	tN(GUU)G	74 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	tN(GUU)K	tN(GUU)K	74 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	tN(GUU)L	tN(GUU)L	74 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	tN(GUU)N1	tN(GUU)N1	74 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	tN(GUU)N2	tN(GUU)N2	74 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	tN(GUU)O1	tN(GUU)O1	74 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	tN(GUU)O2	tN(GUU)O2	74 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	tN(GUU)P	tN(GUU)P	74 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	BNS1	YGR230W	414 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	PRE3	YJL001W	648 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	TEF4	YKL081W	1239 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	YHR045W	YHR045W	1683 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	NUP1	YOR098C	3231 nt		5.01	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	SCS2	YER120W	735 nt		5.01	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	YLL059C	YLL059C	507 nt		5.01	□□□□□ -1.61

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