Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A11Q08AI6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms