Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CXCL9Q07325 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CXCL9Q07325 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms