Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
COL16A1Q07092 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
COL16A1Q07092 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
COL16A1Q07092 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
COL16A1Q07092 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
COL16A1Q07092 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
COL16A1Q07092 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
COL16A1Q07092 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
COL16A1Q07092 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms