Protein–RNA interactions for Protein: Q06587

RING1, E3 ubiquitin-protein ligase RING1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RING1Q06587 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RING1Q06587 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RING1Q06587 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RING1Q06587 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RING1Q06587 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RING1Q06587 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RING1Q06587 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RING1Q06587 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RING1Q06587 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RING1Q06587 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RING1Q06587 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RING1Q06587 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RING1Q06587 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RING1Q06587 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RING1Q06587 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RING1Q06587 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RING1Q06587 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RING1Q06587 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RING1Q06587 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RING1Q06587 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RING1Q06587 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RING1Q06587 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RING1Q06587 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RING1Q06587 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RING1Q06587 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RING1Q06587 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RING1Q06587 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RING1Q06587 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RING1Q06587 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RING1Q06587 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RING1Q06587 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RING1Q06587 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RING1Q06587 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RING1Q06587 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RING1Q06587 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RING1Q06587 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RING1Q06587 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RING1Q06587 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RING1Q06587 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RING1Q06587 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RING1Q06587 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RING1Q06587 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RING1Q06587 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RING1Q06587 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RING1Q06587 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RING1Q06587 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RING1Q06587 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RING1Q06587 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RING1Q06587 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RING1Q06587 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RING1Q06587 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RING1Q06587 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RING1Q06587 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RING1Q06587 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RING1Q06587 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RING1Q06587 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RING1Q06587 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RING1Q06587 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RING1Q06587 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RING1Q06587 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RING1Q06587 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RING1Q06587 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
RING1Q06587 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RING1Q06587 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RING1Q06587 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RING1Q06587 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RING1Q06587 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RING1Q06587 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RING1Q06587 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RING1Q06587 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RING1Q06587 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RING1Q06587 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RING1Q06587 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RING1Q06587 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RING1Q06587 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RING1Q06587 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RING1Q06587 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RING1Q06587 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RING1Q06587 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RING1Q06587 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RING1Q06587 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RING1Q06587 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RING1Q06587 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RING1Q06587 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RING1Q06587 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RING1Q06587 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RING1Q06587 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RING1Q06587 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RING1Q06587 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RING1Q06587 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RING1Q06587 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RING1Q06587 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RING1Q06587 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RING1Q06587 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RING1Q06587 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RING1Q06587 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RING1Q06587 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RING1Q06587 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RING1Q06587 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RING1Q06587 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms