Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRKCZQ05513 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms