Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.03□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.03□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.03□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.03□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 PRP45YAL032C 1140 nt5.03□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 ATG20YDL113C 1923 nt5.03□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 PHO90YJL198W 2646 nt5.03□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 CDC4YFL009W 2340 nt5.02□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 LYS21YDL131W 1323 nt5.02□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 PMT2YAL023C 2280 nt5.02□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 YDL144CYDL144C 1071 nt5.02□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 RAD53YPL153C 2466 nt5.02□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 COX26YDR119W-A 201 nt5.01□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 ERD1YDR414C 1089 nt5.01□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 YLR126CYLR126C 756 nt5.01□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 SEC13YLR208W 894 nt5.01□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 IMD1YAR073W 1212 nt5.01□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 ROX3YBL093C 663 nt5.01□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 HOF1YMR032W 2010 nt5.01□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 KCH1YJR054W 1494 nt5□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 ACS2YLR153C 2052 nt5□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 SIT4YDL047W 936 nt5□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 DBF2YGR092W 1719 nt5□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 TPS3YMR261C 3165 nt5□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 AUA1YFL010W-A 285 nt4.99□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 PRE3YJL001W 648 nt4.99□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 YLR184WYLR184W 348 nt4.99□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 YTH1YPR107C 627 nt4.99□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 NUP1YOR098C 3231 nt4.99□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 MPP10YJR002W 1782 nt4.99□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 HXT14YNL318C 1623 nt4.98□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 PAP1YKR002W 1707 nt4.98□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 UTR4YEL038W 684 nt4.98□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 RSC6YCR052W 1452 nt4.98□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 PAN1YIR006C 4443 nt4.98□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 WTM2YOR229W 1404 nt4.97□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 RCK1YGL158W 1539 nt4.97□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 YLH47YPR125W 1365 nt4.97□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 RPT6YGL048C 1218 nt4.97□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 DBP8YHR169W 1296 nt4.97□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 YLL059CYLL059C 507 nt4.97□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 SNO4YMR322C 714 nt4.97□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 SOL1YNR034W 966 nt4.97□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 HSP33YOR391C 714 nt4.97□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 HSP32YPL280W 714 nt4.97□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 CDC19YAL038W 1503 nt4.97□□□□□ -1.61
YMR226CQ05016 YDL034WYDL034W 345 nt4.96□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 YGL185CYGL185C 1140 nt4.96□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 SCW4YGR279C 1161 nt4.96□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.96□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt4.96□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 RPL21BYPL079W 483 nt4.96□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 QCR2YPR191W 1107 nt4.96□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 URA7YBL039C 1740 nt4.96□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 BRE2YLR015W 1518 nt4.96□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 MCX1YBR227C 1563 nt4.95□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 SPL2YHR136C 447 nt4.95□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 YJR085CYJR085C 318 nt4.95□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 LST8YNL006W 912 nt4.95□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 YNL165WYNL165W 1221 nt4.95□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 ETT1YOR051C 1239 nt4.95□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 PWP1YLR196W 1731 nt4.94□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 APE1YKL103C 1545 nt4.94□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 snR17bsnR17b 332 nt4.94□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 ECM33YBR078W 1290 nt4.94□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 ARR3YPR201W 1215 nt4.94□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 YEF1YEL041W 1488 nt4.94□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 TOS4YLR183C 1470 nt4.94□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 ELP2YGR200C 2367 nt4.93□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 CYK3YDL117W 2658 nt4.93□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 YJL206CYJL206C 2277 nt4.93□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 YPT32YGL210W 669 nt4.93□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 PRR1YKL116C 1557 nt4.93□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 TFS1YLR178C 660 nt4.93□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 YLR346CYLR346C 306 nt4.93□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 NTH2YBR001C 2343 nt4.93□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 DCC1YCL016C 1143 nt4.93□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 SNF3YDL194W 2655 nt4.93□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 FHL1YPR104C 2811 nt4.92□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 AFT1YGL071W 2073 nt4.92□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 TUP1YCR084C 2142 nt4.92□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt4.92□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 SKI6YGR195W 741 nt4.92□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 COS9YKL219W 1224 nt4.92□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 YNL019CYNL019C 855 nt4.92□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 YNL033WYNL033W 855 nt4.92□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 MRPL36YBR122C 534 nt4.92□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 ROT2YBR229C 2865 nt4.91□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 NOT3YIL038C 2511 nt4.91□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 BLM10YFL007W 6432 nt4.91□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 CAD1YDR423C 1230 nt4.91□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 GAL83YER027C 1254 nt4.91□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 ADK2YER170W 678 nt4.91□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 GRX4YER174C 735 nt4.91□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 NAG1YGR031C-A 492 nt4.91□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 PUS5YLR165C 765 nt4.91□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 MRI1YPR118W 1236 nt4.91□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 CDC28YBR160W 897 nt4.91□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 SEC39YLR440C 2130 nt4.91□□□□□ -1.62
YMR226CQ05016 UBX7YBR273C 1311 nt4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.9 ms