Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHLH1Q02575 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NHLH1Q02575 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms