Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EXOSC10Q01780 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
EXOSC10Q01780 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms