Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA6Q01524 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DEFA6Q01524 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms