Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTRA4P83105 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HTRA4P83105 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms