Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKP1P63208 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKP1P63208 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKP1P63208 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKP1P63208 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKP1P63208 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKP1P63208 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKP1P63208 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKP1P63208 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKP1P63208 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKP1P63208 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKP1P63208 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKP1P63208 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKP1P63208 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SKP1P63208 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKP1P63208 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKP1P63208 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKP1P63208 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKP1P63208 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKP1P63208 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKP1P63208 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKP1P63208 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKP1P63208 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKP1P63208 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKP1P63208 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKP1P63208 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKP1P63208 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SKP1P63208 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKP1P63208 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SKP1P63208 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKP1P63208 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKP1P63208 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKP1P63208 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKP1P63208 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKP1P63208 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKP1P63208 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKP1P63208 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKP1P63208 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKP1P63208 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKP1P63208 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKP1P63208 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SKP1P63208 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKP1P63208 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKP1P63208 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKP1P63208 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKP1P63208 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKP1P63208 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKP1P63208 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKP1P63208 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SKP1P63208 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKP1P63208 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKP1P63208 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKP1P63208 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKP1P63208 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKP1P63208 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKP1P63208 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKP1P63208 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKP1P63208 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKP1P63208 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKP1P63208 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKP1P63208 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKP1P63208 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKP1P63208 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SKP1P63208 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKP1P63208 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SKP1P63208 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKP1P63208 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKP1P63208 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKP1P63208 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SKP1P63208 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKP1P63208 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKP1P63208 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKP1P63208 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKP1P63208 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKP1P63208 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKP1P63208 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKP1P63208 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKP1P63208 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKP1P63208 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKP1P63208 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKP1P63208 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKP1P63208 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKP1P63208 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKP1P63208 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKP1P63208 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKP1P63208 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKP1P63208 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKP1P63208 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKP1P63208 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SKP1P63208 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKP1P63208 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKP1P63208 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKP1P63208 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKP1P63208 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKP1P63208 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKP1P63208 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKP1P63208 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SKP1P63208 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKP1P63208 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKP1P63208 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms