Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL38P63173 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL38P63173 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL38P63173 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL38P63173 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL38P63173 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL38P63173 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL38P63173 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL38P63173 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL38P63173 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL38P63173 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL38P63173 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL38P63173 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL38P63173 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL38P63173 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL38P63173 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL38P63173 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL38P63173 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL38P63173 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL38P63173 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL38P63173 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL38P63173 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL38P63173 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL38P63173 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL38P63173 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL38P63173 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL38P63173 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL38P63173 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL38P63173 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL38P63173 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL38P63173 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL38P63173 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL38P63173 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL38P63173 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL38P63173 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL38P63173 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL38P63173 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL38P63173 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL38P63173 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL38P63173 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL38P63173 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL38P63173 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL38P63173 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL38P63173 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL38P63173 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL38P63173 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL38P63173 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL38P63173 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL38P63173 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL38P63173 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL38P63173 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL38P63173 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL38P63173 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL38P63173 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL38P63173 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL38P63173 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL38P63173 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL38P63173 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL38P63173 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL38P63173 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL38P63173 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL38P63173 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL38P63173 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL38P63173 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL38P63173 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL38P63173 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL38P63173 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL38P63173 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL38P63173 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL38P63173 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL38P63173 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL38P63173 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL38P63173 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL38P63173 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL38P63173 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL38P63173 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL38P63173 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL38P63173 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL38P63173 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL38P63173 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL38P63173 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL38P63173 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL38P63173 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL38P63173 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL38P63173 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL38P63173 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL38P63173 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL38P63173 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL38P63173 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL38P63173 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL38P63173 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL38P63173 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL38P63173 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL38P63173 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL38P63173 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPL38P63173 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPL38P63173 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPL38P63173 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL38P63173 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL38P63173 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms