Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF6P49848 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF6P49848 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF6P49848 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF6P49848 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF6P49848 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF6P49848 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF6P49848 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF6P49848 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF6P49848 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF6P49848 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF6P49848 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF6P49848 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF6P49848 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF6P49848 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF6P49848 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF6P49848 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF6P49848 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF6P49848 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF6P49848 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF6P49848 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF6P49848 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF6P49848 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF6P49848 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF6P49848 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF6P49848 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF6P49848 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF6P49848 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF6P49848 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF6P49848 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF6P49848 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF6P49848 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF6P49848 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF6P49848 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF6P49848 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF6P49848 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF6P49848 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF6P49848 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF6P49848 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF6P49848 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF6P49848 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF6P49848 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF6P49848 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF6P49848 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF6P49848 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF6P49848 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF6P49848 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF6P49848 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF6P49848 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF6P49848 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF6P49848 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF6P49848 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF6P49848 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF6P49848 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF6P49848 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF6P49848 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF6P49848 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF6P49848 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF6P49848 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF6P49848 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF6P49848 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF6P49848 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF6P49848 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF6P49848 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF6P49848 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF6P49848 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF6P49848 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF6P49848 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF6P49848 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF6P49848 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF6P49848 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF6P49848 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF6P49848 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF6P49848 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF6P49848 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF6P49848 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF6P49848 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF6P49848 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF6P49848 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TAF6P49848 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TAF6P49848 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF6P49848 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF6P49848 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF6P49848 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF6P49848 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF6P49848 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF6P49848 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF6P49848 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF6P49848 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF6P49848 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF6P49848 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF6P49848 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF6P49848 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF6P49848 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF6P49848 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF6P49848 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF6P49848 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF6P49848 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF6P49848 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF6P49848 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms