Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX1P48742 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX1P48742 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX1P48742 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX1P48742 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX1P48742 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX1P48742 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX1P48742 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX1P48742 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX1P48742 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX1P48742 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX1P48742 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX1P48742 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX1P48742 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX1P48742 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX1P48742 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX1P48742 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX1P48742 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX1P48742 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX1P48742 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX1P48742 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX1P48742 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX1P48742 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX1P48742 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX1P48742 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX1P48742 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX1P48742 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LHX1P48742 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LHX1P48742 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX1P48742 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX1P48742 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX1P48742 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX1P48742 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX1P48742 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX1P48742 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX1P48742 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX1P48742 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX1P48742 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX1P48742 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX1P48742 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX1P48742 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX1P48742 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX1P48742 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX1P48742 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX1P48742 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX1P48742 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX1P48742 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX1P48742 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX1P48742 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX1P48742 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX1P48742 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX1P48742 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX1P48742 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX1P48742 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX1P48742 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX1P48742 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX1P48742 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX1P48742 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX1P48742 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX1P48742 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX1P48742 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX1P48742 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX1P48742 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX1P48742 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX1P48742 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX1P48742 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX1P48742 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX1P48742 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX1P48742 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX1P48742 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX1P48742 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX1P48742 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX1P48742 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX1P48742 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX1P48742 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX1P48742 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX1P48742 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX1P48742 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX1P48742 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX1P48742 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX1P48742 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX1P48742 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX1P48742 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LHX1P48742 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LHX1P48742 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LHX1P48742 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LHX1P48742 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LHX1P48742 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX1P48742 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX1P48742 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX1P48742 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX1P48742 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX1P48742 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX1P48742 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX1P48742 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX1P48742 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX1P48742 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX1P48742 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX1P48742 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX1P48742 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms