Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL29P47914 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL29P47914 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL29P47914 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL29P47914 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL29P47914 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL29P47914 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL29P47914 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL29P47914 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL29P47914 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL29P47914 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL29P47914 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL29P47914 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL29P47914 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL29P47914 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL29P47914 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL29P47914 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL29P47914 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL29P47914 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL29P47914 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL29P47914 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL29P47914 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL29P47914 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL29P47914 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL29P47914 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL29P47914 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL29P47914 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL29P47914 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL29P47914 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL29P47914 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL29P47914 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL29P47914 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL29P47914 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL29P47914 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL29P47914 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL29P47914 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL29P47914 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL29P47914 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL29P47914 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL29P47914 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL29P47914 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL29P47914 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL29P47914 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL29P47914 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL29P47914 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL29P47914 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL29P47914 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL29P47914 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL29P47914 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL29P47914 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL29P47914 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL29P47914 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL29P47914 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL29P47914 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL29P47914 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL29P47914 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL29P47914 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL29P47914 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL29P47914 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL29P47914 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL29P47914 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL29P47914 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL29P47914 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL29P47914 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL29P47914 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL29P47914 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL29P47914 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL29P47914 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL29P47914 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL29P47914 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL29P47914 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL29P47914 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL29P47914 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL29P47914 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL29P47914 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL29P47914 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL29P47914 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL29P47914 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL29P47914 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL29P47914 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL29P47914 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL29P47914 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL29P47914 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL29P47914 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL29P47914 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL29P47914 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL29P47914 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL29P47914 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL29P47914 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL29P47914 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL29P47914 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL29P47914 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL29P47914 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL29P47914 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL29P47914 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL29P47914 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL29P47914 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL29P47914 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL29P47914 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL29P47914 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms