Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZBP47756 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms