Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR4P46093 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR4P46093 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR4P46093 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR4P46093 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR4P46093 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR4P46093 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR4P46093 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR4P46093 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR4P46093 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR4P46093 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR4P46093 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR4P46093 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR4P46093 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR4P46093 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR4P46093 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR4P46093 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR4P46093 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR4P46093 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR4P46093 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR4P46093 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR4P46093 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR4P46093 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR4P46093 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR4P46093 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR4P46093 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR4P46093 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR4P46093 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR4P46093 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR4P46093 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR4P46093 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR4P46093 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR4P46093 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR4P46093 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR4P46093 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR4P46093 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR4P46093 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR4P46093 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR4P46093 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR4P46093 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR4P46093 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR4P46093 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR4P46093 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR4P46093 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR4P46093 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR4P46093 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR4P46093 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR4P46093 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR4P46093 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR4P46093 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR4P46093 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR4P46093 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR4P46093 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR4P46093 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR4P46093 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR4P46093 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR4P46093 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR4P46093 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR4P46093 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR4P46093 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR4P46093 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPR4P46093 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPR4P46093 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPR4P46093 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GPR4P46093 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPR4P46093 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPR4P46093 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPR4P46093 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPR4P46093 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR4P46093 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR4P46093 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR4P46093 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR4P46093 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR4P46093 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR4P46093 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR4P46093 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR4P46093 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR4P46093 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR4P46093 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR4P46093 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR4P46093 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR4P46093 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR4P46093 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR4P46093 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR4P46093 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR4P46093 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR4P46093 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR4P46093 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR4P46093 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR4P46093 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR4P46093 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR4P46093 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR4P46093 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR4P46093 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR4P46093 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR4P46093 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR4P46093 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR4P46093 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR4P46093 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR4P46093 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms