Protein–RNA interactions for Protein: P43378

PTPN9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN9P43378 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPN9P43378 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPN9P43378 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN9P43378 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms