Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP12P39900 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP12P39900 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP12P39900 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP12P39900 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP12P39900 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP12P39900 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP12P39900 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP12P39900 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP12P39900 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP12P39900 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP12P39900 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP12P39900 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP12P39900 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP12P39900 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP12P39900 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP12P39900 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP12P39900 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP12P39900 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP12P39900 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP12P39900 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP12P39900 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP12P39900 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP12P39900 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP12P39900 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP12P39900 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP12P39900 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP12P39900 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP12P39900 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP12P39900 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP12P39900 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP12P39900 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP12P39900 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP12P39900 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP12P39900 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP12P39900 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP12P39900 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP12P39900 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP12P39900 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP12P39900 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP12P39900 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP12P39900 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP12P39900 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP12P39900 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP12P39900 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP12P39900 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP12P39900 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP12P39900 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP12P39900 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP12P39900 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP12P39900 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP12P39900 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP12P39900 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP12P39900 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP12P39900 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP12P39900 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP12P39900 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP12P39900 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP12P39900 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP12P39900 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP12P39900 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP12P39900 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP12P39900 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP12P39900 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP12P39900 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP12P39900 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP12P39900 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP12P39900 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP12P39900 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP12P39900 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP12P39900 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP12P39900 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP12P39900 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP12P39900 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP12P39900 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP12P39900 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP12P39900 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP12P39900 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP12P39900 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP12P39900 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP12P39900 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP12P39900 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP12P39900 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP12P39900 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP12P39900 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP12P39900 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP12P39900 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP12P39900 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP12P39900 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP12P39900 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP12P39900 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP12P39900 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP12P39900 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP12P39900 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP12P39900 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP12P39900 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP12P39900 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP12P39900 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP12P39900 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP12P39900 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms