Protein–RNA interactions for Protein: P39543

SOP4, Protein SOP4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOP4P39543 DCI1YOR180C 816 nt4.96□□□□□ -1.62
SOP4P39543 CNM67YNL225C 1746 nt4.96□□□□□ -1.62
SOP4P39543 YHR045WYHR045W 1683 nt4.96□□□□□ -1.62
SOP4P39543 SIT4YDL047W 936 nt4.95□□□□□ -1.62
SOP4P39543 RPL12AYEL054C 498 nt4.95□□□□□ -1.62
SOP4P39543 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.95□□□□□ -1.62
SOP4P39543 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.95□□□□□ -1.62
SOP4P39543 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.95□□□□□ -1.62
SOP4P39543 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.95□□□□□ -1.62
SOP4P39543 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.95□□□□□ -1.62
SOP4P39543 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.95□□□□□ -1.62
SOP4P39543 CAX4YGR036C 720 nt4.95□□□□□ -1.62
SOP4P39543 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.95□□□□□ -1.62
SOP4P39543 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.95□□□□□ -1.62
SOP4P39543 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.95□□□□□ -1.62
SOP4P39543 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.95□□□□□ -1.62
SOP4P39543 GTO1YGR154C 1071 nt4.95□□□□□ -1.62
SOP4P39543 ECM19YLR390W 339 nt4.95□□□□□ -1.62
SOP4P39543 ROX3YBL093C 663 nt4.95□□□□□ -1.62
SOP4P39543 HOF1YMR032W 2010 nt4.95□□□□□ -1.62
SOP4P39543 PUS1YPL212C 1635 nt4.94□□□□□ -1.62
SOP4P39543 VTH1YIL173W 4650 nt4.94□□□□□ -1.62
SOP4P39543 VTH2YJL222W 4650 nt4.94□□□□□ -1.62
SOP4P39543 AAD4YDL243C 990 nt4.94□□□□□ -1.62
SOP4P39543 ENV7YPL236C 1095 nt4.94□□□□□ -1.62
SOP4P39543 PXA1YPL147W 2613 nt4.94□□□□□ -1.62
SOP4P39543 UGA1YGR019W 1416 nt4.94□□□□□ -1.62
SOP4P39543 DAL81YIR023W 2913 nt4.94□□□□□ -1.62
SOP4P39543 ECM7YLR443W 1347 nt4.94□□□□□ -1.62
SOP4P39543 ULA1YPL003W 1389 nt4.93□□□□□ -1.62
SOP4P39543 ARB1YER036C 1833 nt4.93□□□□□ -1.62
SOP4P39543 YDL034WYDL034W 345 nt4.93□□□□□ -1.62
SOP4P39543 PEX19YDL065C 1029 nt4.93□□□□□ -1.62
SOP4P39543 YDR154CYDR154C 351 nt4.93□□□□□ -1.62
SOP4P39543 APM4YOL062C 1476 nt4.93□□□□□ -1.62
SOP4P39543 YFL034WYFL034W 3222 nt4.93□□□□□ -1.62
SOP4P39543 SEC9YGR009C 1956 nt4.93□□□□□ -1.62
SOP4P39543 STE7YDL159W 1548 nt4.92□□□□□ -1.62
SOP4P39543 STE20YHL007C 2820 nt4.92□□□□□ -1.62
SOP4P39543 RPS16BYDL083C 432 nt4.92□□□□□ -1.62
SOP4P39543 AI5_BETAQ0075 1065 nt4.92□□□□□ -1.62
SOP4P39543 PRS2YER099C 957 nt4.92□□□□□ -1.62
SOP4P39543 CBT1YKL208W 816 nt4.92□□□□□ -1.62
SOP4P39543 YLR346CYLR346C 306 nt4.92□□□□□ -1.62
SOP4P39543 MDY2YOL111C 639 nt4.92□□□□□ -1.62
SOP4P39543 PIN2YOR104W 849 nt4.92□□□□□ -1.62
SOP4P39543 PAL1YDR348C 1500 nt4.92□□□□□ -1.62
SOP4P39543 APL6YGR261C 2430 nt4.92□□□□□ -1.62
SOP4P39543 MGS1YNL218W 1764 nt4.91□□□□□ -1.62
SOP4P39543 SUA5YGL169W 1281 nt4.91□□□□□ -1.62
SOP4P39543 SPO7YAL009W 780 nt4.91□□□□□ -1.62
SOP4P39543 ZRT2YLR130C 1269 nt4.91□□□□□ -1.62
SOP4P39543 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt4.91□□□□□ -1.62
SOP4P39543 PPG1YNR032W 1107 nt4.91□□□□□ -1.62
SOP4P39543 DUR1,2YBR208C 5508 nt4.91□□□□□ -1.62
SOP4P39543 VHS2YIL135C 1311 nt4.91□□□□□ -1.62
SOP4P39543 PMT2YAL023C 2280 nt4.9□□□□□ -1.62
SOP4P39543 PUF3YLL013C 2640 nt4.9□□□□□ -1.62
SOP4P39543 COX26YDR119W-A 201 nt4.9□□□□□ -1.63
SOP4P39543 RPL21BYPL079W 483 nt4.9□□□□□ -1.63
SOP4P39543 MPP10YJR002W 1782 nt4.9□□□□□ -1.63
SOP4P39543 MMP1YLL061W 1752 nt4.9□□□□□ -1.63
SOP4P39543 FHL1YPR104C 2811 nt4.9□□□□□ -1.63
SOP4P39543 ATG20YDL113C 1923 nt4.89□□□□□ -1.63
SOP4P39543 YDL144CYDL144C 1071 nt4.89□□□□□ -1.63
SOP4P39543 ERD1YDR414C 1089 nt4.89□□□□□ -1.63
SOP4P39543 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.89□□□□□ -1.63
SOP4P39543 ARN1YHL040C 1884 nt4.89□□□□□ -1.63
SOP4P39543 FUM1YPL262W 1467 nt4.88□□□□□ -1.63
SOP4P39543 ATG18YFR021W 1503 nt4.88□□□□□ -1.63
SOP4P39543 HXT14YNL318C 1623 nt4.88□□□□□ -1.63
SOP4P39543 YLL059CYLL059C 507 nt4.88□□□□□ -1.63
SOP4P39543 YLR126CYLR126C 756 nt4.88□□□□□ -1.63
SOP4P39543 NGR1YBR212W 2019 nt4.88□□□□□ -1.63
SOP4P39543 TOS3YGL179C 1683 nt4.88□□□□□ -1.63
SOP4P39543 NOT3YIL038C 2511 nt4.88□□□□□ -1.63
SOP4P39543 PMA1YGL008C 2757 nt4.87□□□□□ -1.63
SOP4P39543 UBP9YER098W 2265 nt4.87□□□□□ -1.63
SOP4P39543 MHF2YDL160C-A 243 nt4.87□□□□□ -1.63
SOP4P39543 ECT1YGR007W 972 nt4.87□□□□□ -1.63
SOP4P39543 PRE3YJL001W 648 nt4.87□□□□□ -1.63
SOP4P39543 PRP45YAL032C 1140 nt4.87□□□□□ -1.63
SOP4P39543 SOL1YNR034W 966 nt4.87□□□□□ -1.63
SOP4P39543 YPL062WYPL062W 405 nt4.87□□□□□ -1.63
SOP4P39543 RSC6YCR052W 1452 nt4.87□□□□□ -1.63
SOP4P39543 GUS1YGL245W 2127 nt4.87□□□□□ -1.63
SOP4P39543 ATH1YPR026W 3636 nt4.86□□□□□ -1.63
SOP4P39543 CDC4YFL009W 2340 nt4.86□□□□□ -1.63
SOP4P39543 SNF11YDR073W 510 nt4.86□□□□□ -1.63
SOP4P39543 UTR4YEL038W 684 nt4.86□□□□□ -1.63
SOP4P39543 YER084WYER084W 387 nt4.86□□□□□ -1.63
SOP4P39543 SEC13YLR208W 894 nt4.86□□□□□ -1.63
SOP4P39543 RDL1YOR285W 420 nt4.86□□□□□ -1.63
SOP4P39543 PHO90YJL198W 2646 nt4.85□□□□□ -1.63
SOP4P39543 SCW4YGR279C 1161 nt4.85□□□□□ -1.63
SOP4P39543 COS9YKL219W 1224 nt4.85□□□□□ -1.63
SOP4P39543 LST8YNL006W 912 nt4.85□□□□□ -1.63
SOP4P39543 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt4.85□□□□□ -1.63
SOP4P39543 BRE2YLR015W 1518 nt4.85□□□□□ -1.63
SOP4P39543 PRR1YKL116C 1557 nt4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.8 ms