Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP62P37198 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP62P37198 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP62P37198 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP62P37198 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP62P37198 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP62P37198 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP62P37198 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP62P37198 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP62P37198 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP62P37198 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP62P37198 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP62P37198 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP62P37198 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP62P37198 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP62P37198 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP62P37198 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP62P37198 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP62P37198 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP62P37198 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP62P37198 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP62P37198 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP62P37198 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP62P37198 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP62P37198 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP62P37198 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP62P37198 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP62P37198 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP62P37198 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP62P37198 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP62P37198 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP62P37198 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP62P37198 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP62P37198 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP62P37198 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP62P37198 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP62P37198 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP62P37198 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP62P37198 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP62P37198 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP62P37198 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP62P37198 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP62P37198 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP62P37198 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP62P37198 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP62P37198 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP62P37198 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP62P37198 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP62P37198 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP62P37198 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP62P37198 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP62P37198 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP62P37198 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP62P37198 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP62P37198 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP62P37198 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP62P37198 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP62P37198 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP62P37198 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP62P37198 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP62P37198 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP62P37198 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP62P37198 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP62P37198 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP62P37198 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP62P37198 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP62P37198 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP62P37198 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP62P37198 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP62P37198 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP62P37198 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP62P37198 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP62P37198 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP62P37198 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP62P37198 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP62P37198 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP62P37198 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP62P37198 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP62P37198 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP62P37198 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP62P37198 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP62P37198 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP62P37198 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP62P37198 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP62P37198 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP62P37198 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP62P37198 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP62P37198 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP62P37198 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP62P37198 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP62P37198 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP62P37198 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP62P37198 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP62P37198 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP62P37198 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP62P37198 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP62P37198 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUP62P37198 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUP62P37198 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUP62P37198 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms