Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LSP1P33241 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSP1P33241 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSP1P33241 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSP1P33241 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSP1P33241 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSP1P33241 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSP1P33241 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSP1P33241 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSP1P33241 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSP1P33241 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSP1P33241 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSP1P33241 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSP1P33241 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LSP1P33241 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSP1P33241 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSP1P33241 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSP1P33241 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSP1P33241 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSP1P33241 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSP1P33241 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSP1P33241 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSP1P33241 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSP1P33241 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSP1P33241 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSP1P33241 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSP1P33241 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSP1P33241 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSP1P33241 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LSP1P33241 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSP1P33241 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSP1P33241 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSP1P33241 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSP1P33241 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSP1P33241 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSP1P33241 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSP1P33241 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSP1P33241 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSP1P33241 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSP1P33241 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSP1P33241 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSP1P33241 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSP1P33241 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSP1P33241 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSP1P33241 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSP1P33241 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSP1P33241 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSP1P33241 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LSP1P33241 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSP1P33241 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSP1P33241 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSP1P33241 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSP1P33241 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSP1P33241 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSP1P33241 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSP1P33241 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSP1P33241 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LSP1P33241 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSP1P33241 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSP1P33241 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSP1P33241 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSP1P33241 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSP1P33241 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSP1P33241 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSP1P33241 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSP1P33241 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSP1P33241 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSP1P33241 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSP1P33241 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSP1P33241 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSP1P33241 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSP1P33241 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSP1P33241 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSP1P33241 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSP1P33241 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSP1P33241 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSP1P33241 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSP1P33241 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSP1P33241 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSP1P33241 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSP1P33241 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSP1P33241 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LSP1P33241 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSP1P33241 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSP1P33241 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSP1P33241 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSP1P33241 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSP1P33241 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSP1P33241 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSP1P33241 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSP1P33241 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSP1P33241 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSP1P33241 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSP1P33241 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSP1P33241 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSP1P33241 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LSP1P33241 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LSP1P33241 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSP1P33241 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSP1P33241 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms