Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	ILV1	YER086W	1731 nt		5.14	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	FAA4	YMR246W	2085 nt		5.14	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	RAD53	YPL153C	2466 nt		5.14	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	IXR1	YKL032C	1794 nt		5.14	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	BIO3	YNR058W	1443 nt		5.14	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	YDL114W	YDL114W	927 nt		5.13	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	YDL183C	YDL183C	963 nt		5.13	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	YDR161W	YDR161W	1164 nt		5.13	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	RPL12A	YEL054C	498 nt		5.13	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	CIR1	YGR207C	786 nt		5.13	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	GRE3	YHR104W	984 nt		5.13	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	UIP3	YAR027W	708 nt		5.13	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	CLP1	YOR250C	1338 nt		5.13	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	PMA1	YGL008C	2757 nt		5.13	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	COQ6	YGR255C	1440 nt		5.13	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	GUD1	YDL238C	1470 nt		5.13	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	MPH3	YJR160C	1809 nt		5.12	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	PHO86	YJL117W	936 nt		5.12	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	LDB7	YBL006C	543 nt		5.12	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	SCS7	YMR272C	1155 nt		5.12	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	PUS4	YNL292W	1212 nt		5.12	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	TFG1	YGR186W	2208 nt		5.12	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	STE12	YHR084W	2067 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	PLB3	YOL011W	2061 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	DBF4	YDR052C	2115 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	BUG1	YDL099W	1026 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	PRS2	YER099C	957 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	SNZ3	YFL059W	897 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	SKI6	YGR195W	741 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	LIA1	YJR070C	978 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	YJR084W	YJR084W	1272 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	TAL1	YLR354C	1008 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	PFA3	YNL326C	1011 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	SNZ2	YNL333W	897 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	ANT1	YPR128C	987 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	YHL012W	YHL012W	1482 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	SIP5	YMR140W	1470 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	ASF2	YDL197C	1578 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	YCK1	YHR135C	1617 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	HXT7	YDR342C	1713 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	HXT6	YDR343C	1713 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	TRP4	YDR354W	1143 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	STL1	YDR536W	1710 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	ARB1	YER036C	1833 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	YER138W-A	YER138W-A	105 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	TIM21	YGR033C	720 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	DBF2	YGR092W	1719 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	ERG1	YGR175C	1491 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	OKP1	YGR179C	1221 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	CRH1	YGR189C	1524 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	BUD32	YGR262C	786 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	MND2	YIR025W	1107 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	YLR326W	YLR326W	723 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	YMD8	YML038C	1329 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	SNO1	YMR095C	675 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	YIM2	YMR151W	438 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	PCL1	YNL289W	840 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	YOL038C-A	YOL038C-A	96 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	YBL107W-A	YBL107W-A	105 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	BAG7	YOR134W	1230 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	SIA1	YOR137C	1869 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	LSC1	YOR142W	990 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	SMP1	YBR182C	1359 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	RRT2	YBR246W	1164 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	PTC3	YBL056W	1407 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	YJR124C	YJR124C	1347 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	GET3	YDL100C	1065 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	YDR282C	YDR282C	1245 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	YDR336W	YDR336W	945 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	RPN11	YFR004W	921 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	IRC6	YFR043C	714 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	DSD1	YGL196W	1287 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	tR(UCU)Q1	tR(UCU)Q1	73 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	TFA2	YKR062W	987 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	MRPS8	YMR158W	468 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	RPS3	YNL178W	723 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	RPL3	YOR063W	1164 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	YPR015C	YPR015C	744 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	PEX34	YCL056C	435 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SIP1	P32578	MUP3	YHL036W	1641 nt		5.08	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	GAS3	YMR215W	1575 nt		5.08	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	APE1	YKL103C	1545 nt		5.08	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	DFG5	YMR238W	1377 nt		5.08	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	DEG1	YFL001W	1329 nt		5.08	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	YHR137C-A	YHR137C-A	651 nt		5.08	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	ASF1	YJL115W	840 nt		5.08	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	DAN1	YJR150C	897 nt		5.08	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	PRS1	YKL181W	1284 nt		5.08	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	YPL168W	YPL168W	1293 nt		5.08	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	snR32	snR32	188 nt		5.08	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	YEL077C	YEL077C	3834 nt		5.08	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	NGL2	YMR285C	1548 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	HFI1	YPL254W	1467 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	ENT2	YLR206W	1842 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	PRT1	YOR361C	2292 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	HST3	YOR025W	1344 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	GPD1	YDL022W	1176 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	YDR053W	YDR053W	396 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	CAD1	YDR423C	1230 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	FMO1	YHR176W	1299 nt		5.07	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.5 ms