Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRA5P31644 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA5P31644 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA5P31644 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms