Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCSK1P29120 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK1P29120 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms