Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD3P28288 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms