Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPREP23469 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPREP23469 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPREP23469 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPREP23469 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPREP23469 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPREP23469 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPREP23469 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPREP23469 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPREP23469 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPREP23469 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPREP23469 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPREP23469 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPREP23469 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPREP23469 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPREP23469 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPREP23469 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPREP23469 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPREP23469 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPREP23469 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPREP23469 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPREP23469 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPREP23469 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPREP23469 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPREP23469 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPREP23469 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPREP23469 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPREP23469 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPREP23469 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPREP23469 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPREP23469 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPREP23469 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPREP23469 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPREP23469 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPREP23469 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPREP23469 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPREP23469 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPREP23469 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPREP23469 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPREP23469 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPREP23469 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPREP23469 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPREP23469 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPREP23469 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPREP23469 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPREP23469 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPREP23469 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPREP23469 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPREP23469 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPREP23469 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPREP23469 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPREP23469 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPREP23469 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPREP23469 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPREP23469 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPREP23469 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPREP23469 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPREP23469 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPREP23469 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPREP23469 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPREP23469 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPREP23469 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPREP23469 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPREP23469 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPREP23469 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPREP23469 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPREP23469 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPREP23469 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPREP23469 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPREP23469 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPREP23469 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPREP23469 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPREP23469 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPREP23469 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPREP23469 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPREP23469 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPREP23469 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPREP23469 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPREP23469 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPREP23469 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPREP23469 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPREP23469 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPREP23469 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPREP23469 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPREP23469 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPREP23469 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPREP23469 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPREP23469 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPREP23469 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPREP23469 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPREP23469 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPREP23469 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPREP23469 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPREP23469 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPREP23469 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPREP23469 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPREP23469 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPREP23469 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPREP23469 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPREP23469 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms