Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRDP23468 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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