Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYF6P23409 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYF6P23409 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYF6P23409 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYF6P23409 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYF6P23409 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYF6P23409 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYF6P23409 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYF6P23409 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MYF6P23409 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYF6P23409 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MYF6P23409 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYF6P23409 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYF6P23409 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYF6P23409 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYF6P23409 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYF6P23409 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYF6P23409 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYF6P23409 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYF6P23409 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYF6P23409 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYF6P23409 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYF6P23409 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYF6P23409 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYF6P23409 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYF6P23409 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYF6P23409 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYF6P23409 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYF6P23409 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYF6P23409 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYF6P23409 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF6P23409 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF6P23409 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF6P23409 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF6P23409 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF6P23409 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF6P23409 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF6P23409 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF6P23409 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF6P23409 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF6P23409 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MYF6P23409 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYF6P23409 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYF6P23409 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYF6P23409 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYF6P23409 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MYF6P23409 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MYF6P23409 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MYF6P23409 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MYF6P23409 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYF6P23409 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYF6P23409 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYF6P23409 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYF6P23409 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MYF6P23409 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYF6P23409 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MYF6P23409 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYF6P23409 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYF6P23409 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYF6P23409 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYF6P23409 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYF6P23409 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYF6P23409 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MYF6P23409 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYF6P23409 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYF6P23409 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYF6P23409 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYF6P23409 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYF6P23409 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MYF6P23409 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYF6P23409 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYF6P23409 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYF6P23409 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYF6P23409 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYF6P23409 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYF6P23409 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYF6P23409 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYF6P23409 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYF6P23409 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MYF6P23409 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYF6P23409 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYF6P23409 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYF6P23409 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MYF6P23409 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MYF6P23409 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYF6P23409 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MYF6P23409 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYF6P23409 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYF6P23409 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYF6P23409 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MYF6P23409 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYF6P23409 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYF6P23409 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MYF6P23409 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MYF6P23409 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MYF6P23409 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYF6P23409 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYF6P23409 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MYF6P23409 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MYF6P23409 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms