Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCN1P20061 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCN1P20061 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TCN1P20061 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCN1P20061 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCN1P20061 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCN1P20061 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCN1P20061 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCN1P20061 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCN1P20061 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCN1P20061 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCN1P20061 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCN1P20061 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCN1P20061 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCN1P20061 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCN1P20061 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCN1P20061 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCN1P20061 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCN1P20061 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCN1P20061 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCN1P20061 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCN1P20061 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCN1P20061 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCN1P20061 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCN1P20061 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCN1P20061 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCN1P20061 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TCN1P20061 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCN1P20061 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCN1P20061 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCN1P20061 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCN1P20061 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCN1P20061 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCN1P20061 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCN1P20061 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCN1P20061 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCN1P20061 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCN1P20061 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCN1P20061 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCN1P20061 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCN1P20061 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN1P20061 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN1P20061 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN1P20061 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN1P20061 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN1P20061 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN1P20061 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN1P20061 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN1P20061 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN1P20061 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN1P20061 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN1P20061 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN1P20061 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN1P20061 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN1P20061 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN1P20061 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN1P20061 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN1P20061 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN1P20061 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN1P20061 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCN1P20061 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCN1P20061 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCN1P20061 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCN1P20061 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCN1P20061 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCN1P20061 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCN1P20061 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCN1P20061 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCN1P20061 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCN1P20061 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCN1P20061 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCN1P20061 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCN1P20061 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCN1P20061 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCN1P20061 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCN1P20061 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCN1P20061 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCN1P20061 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCN1P20061 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCN1P20061 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCN1P20061 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCN1P20061 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCN1P20061 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCN1P20061 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCN1P20061 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCN1P20061 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCN1P20061 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCN1P20061 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCN1P20061 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCN1P20061 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCN1P20061 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCN1P20061 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCN1P20061 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCN1P20061 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCN1P20061 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCN1P20061 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCN1P20061 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCN1P20061 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TCN1P20061 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCN1P20061 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms