Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPL17P18621 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL17P18621 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL17P18621 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL17P18621 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL17P18621 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL17P18621 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL17P18621 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL17P18621 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL17P18621 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL17P18621 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL17P18621 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL17P18621 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL17P18621 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL17P18621 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPL17P18621 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPL17P18621 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPL17P18621 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RPL17P18621 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RPL17P18621 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPL17P18621 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL17P18621 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL17P18621 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL17P18621 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL17P18621 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL17P18621 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL17P18621 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL17P18621 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL17P18621 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL17P18621 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL17P18621 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL17P18621 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL17P18621 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL17P18621 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL17P18621 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL17P18621 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL17P18621 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL17P18621 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL17P18621 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL17P18621 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL17P18621 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL17P18621 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL17P18621 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL17P18621 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL17P18621 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPL17P18621 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPL17P18621 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPL17P18621 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPL17P18621 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPL17P18621 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPL17P18621 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPL17P18621 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPL17P18621 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPL17P18621 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPL17P18621 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPL17P18621 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPL17P18621 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPL17P18621 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RPL17P18621 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPL17P18621 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPL17P18621 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPL17P18621 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPL17P18621 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPL17P18621 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL17P18621 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL17P18621 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL17P18621 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL17P18621 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL17P18621 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL17P18621 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL17P18621 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPL17P18621 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPL17P18621 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RPL17P18621 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPL17P18621 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPL17P18621 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPL17P18621 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPL17P18621 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL17P18621 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL17P18621 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL17P18621 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL17P18621 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL17P18621 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL17P18621 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL17P18621 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL17P18621 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL17P18621 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL17P18621 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL17P18621 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL17P18621 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL17P18621 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL17P18621 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPL17P18621 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL17P18621 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL17P18621 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL17P18621 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL17P18621 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL17P18621 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL17P18621 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL17P18621 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms