Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA1P17302 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA1P17302 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA1P17302 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA1P17302 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA1P17302 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA1P17302 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA1P17302 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA1P17302 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA1P17302 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA1P17302 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA1P17302 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA1P17302 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA1P17302 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA1P17302 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA1P17302 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA1P17302 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA1P17302 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA1P17302 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA1P17302 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA1P17302 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA1P17302 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA1P17302 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA1P17302 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA1P17302 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA1P17302 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA1P17302 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA1P17302 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA1P17302 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA1P17302 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA1P17302 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA1P17302 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA1P17302 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA1P17302 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA1P17302 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA1P17302 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA1P17302 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA1P17302 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA1P17302 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA1P17302 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA1P17302 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA1P17302 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA1P17302 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA1P17302 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA1P17302 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA1P17302 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA1P17302 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA1P17302 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA1P17302 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA1P17302 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA1P17302 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA1P17302 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA1P17302 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA1P17302 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA1P17302 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA1P17302 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA1P17302 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA1P17302 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA1P17302 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA1P17302 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA1P17302 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA1P17302 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA1P17302 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA1P17302 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA1P17302 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA1P17302 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA1P17302 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA1P17302 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA1P17302 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA1P17302 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJA1P17302 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA1P17302 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA1P17302 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA1P17302 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA1P17302 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA1P17302 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA1P17302 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA1P17302 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA1P17302 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA1P17302 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA1P17302 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA1P17302 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA1P17302 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA1P17302 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA1P17302 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA1P17302 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA1P17302 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA1P17302 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA1P17302 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA1P17302 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA1P17302 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA1P17302 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA1P17302 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA1P17302 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA1P17302 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA1P17302 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA1P17302 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA1P17302 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA1P17302 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA1P17302 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms