Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE6AP16499 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE6AP16499 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms