Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD44P16070 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD44P16070 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD44P16070 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD44P16070 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD44P16070 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD44P16070 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD44P16070 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD44P16070 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD44P16070 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD44P16070 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD44P16070 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD44P16070 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD44P16070 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD44P16070 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD44P16070 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD44P16070 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD44P16070 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD44P16070 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD44P16070 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD44P16070 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD44P16070 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD44P16070 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD44P16070 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD44P16070 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD44P16070 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD44P16070 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD44P16070 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD44P16070 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD44P16070 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD44P16070 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD44P16070 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CD44P16070 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD44P16070 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD44P16070 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD44P16070 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD44P16070 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD44P16070 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD44P16070 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD44P16070 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CD44P16070 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD44P16070 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD44P16070 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD44P16070 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD44P16070 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD44P16070 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD44P16070 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD44P16070 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD44P16070 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD44P16070 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD44P16070 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CD44P16070 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD44P16070 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD44P16070 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CD44P16070 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CD44P16070 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CD44P16070 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CD44P16070 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD44P16070 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD44P16070 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD44P16070 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD44P16070 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CD44P16070 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD44P16070 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD44P16070 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CD44P16070 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD44P16070 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD44P16070 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD44P16070 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD44P16070 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD44P16070 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD44P16070 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD44P16070 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD44P16070 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD44P16070 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD44P16070 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD44P16070 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD44P16070 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD44P16070 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD44P16070 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD44P16070 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD44P16070 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD44P16070 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD44P16070 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD44P16070 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD44P16070 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD44P16070 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD44P16070 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD44P16070 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD44P16070 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD44P16070 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD44P16070 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD44P16070 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD44P16070 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CD44P16070 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD44P16070 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD44P16070 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD44P16070 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CD44P16070 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CD44P16070 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms