Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSF2RAP15509 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CSF2RAP15509 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF2RAP15509 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms