Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRP12270 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRP12270 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPRP12270 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPRP12270 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPRP12270 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRP12270 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRP12270 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRP12270 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRP12270 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRP12270 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRP12270 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRP12270 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRP12270 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRP12270 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRP12270 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRP12270 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRP12270 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRP12270 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRP12270 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRP12270 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRP12270 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRP12270 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRP12270 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRP12270 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRP12270 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRP12270 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRP12270 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRP12270 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRP12270 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRP12270 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRP12270 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRP12270 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRP12270 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRP12270 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRP12270 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRP12270 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRP12270 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRP12270 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRP12270 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRP12270 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRP12270 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRP12270 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRP12270 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRP12270 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRP12270 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRP12270 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRP12270 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRP12270 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRP12270 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRP12270 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRP12270 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRP12270 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRP12270 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRP12270 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRP12270 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRP12270 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRP12270 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRP12270 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRP12270 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPRP12270 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPRP12270 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPRP12270 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRP12270 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRP12270 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRP12270 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRP12270 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRP12270 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRP12270 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRP12270 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRP12270 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRP12270 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRP12270 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRP12270 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRP12270 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRP12270 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRP12270 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRP12270 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRP12270 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRP12270 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRP12270 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRP12270 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRP12270 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRP12270 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRP12270 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRP12270 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRP12270 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRP12270 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRP12270 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRP12270 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRP12270 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRP12270 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRP12270 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRP12270 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRP12270 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRP12270 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRP12270 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRP12270 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRP12270 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRP12270 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms