Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP1P09874 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP1P09874 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP1P09874 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP1P09874 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP1P09874 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP1P09874 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP1P09874 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP1P09874 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP1P09874 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP1P09874 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP1P09874 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP1P09874 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP1P09874 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP1P09874 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP1P09874 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP1P09874 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP1P09874 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP1P09874 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP1P09874 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP1P09874 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP1P09874 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP1P09874 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP1P09874 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP1P09874 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP1P09874 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP1P09874 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP1P09874 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP1P09874 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP1P09874 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP1P09874 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP1P09874 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP1P09874 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP1P09874 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP1P09874 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP1P09874 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP1P09874 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP1P09874 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP1P09874 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP1P09874 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP1P09874 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP1P09874 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PARP1P09874 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP1P09874 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP1P09874 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP1P09874 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP1P09874 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP1P09874 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP1P09874 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARP1P09874 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARP1P09874 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PARP1P09874 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PARP1P09874 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PARP1P09874 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PARP1P09874 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PARP1P09874 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PARP1P09874 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP1P09874 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP1P09874 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP1P09874 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP1P09874 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP1P09874 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP1P09874 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP1P09874 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP1P09874 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP1P09874 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP1P09874 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP1P09874 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP1P09874 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP1P09874 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP1P09874 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP1P09874 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP1P09874 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP1P09874 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP1P09874 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP1P09874 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP1P09874 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP1P09874 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP1P09874 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP1P09874 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP1P09874 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP1P09874 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP1P09874 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP1P09874 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP1P09874 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP1P09874 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP1P09874 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP1P09874 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP1P09874 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP1P09874 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP1P09874 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP1P09874 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP1P09874 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP1P09874 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP1P09874 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP1P09874 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP1P09874 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP1P09874 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP1P09874 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PARP1P09874 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms