Protein–RNA interactions for Protein: P08579

SNRPB2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPB2P08579 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPB2P08579 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRPB2P08579 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms