Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSF1RP07333 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 259.3 ms