Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFNA4P05014 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFNA4P05014 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFNA4P05014 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFNA4P05014 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFNA4P05014 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IFNA4P05014 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms