Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD3O95983 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD3O95983 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD3O95983 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD3O95983 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD3O95983 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MBD3O95983 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MBD3O95983 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MBD3O95983 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MBD3O95983 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MBD3O95983 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MBD3O95983 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MBD3O95983 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MBD3O95983 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MBD3O95983 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MBD3O95983 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MBD3O95983 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MBD3O95983 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MBD3O95983 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MBD3O95983 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MBD3O95983 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MBD3O95983 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MBD3O95983 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MBD3O95983 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MBD3O95983 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MBD3O95983 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MBD3O95983 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MBD3O95983 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MBD3O95983 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MBD3O95983 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MBD3O95983 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MBD3O95983 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MBD3O95983 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MBD3O95983 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MBD3O95983 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MBD3O95983 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MBD3O95983 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MBD3O95983 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MBD3O95983 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MBD3O95983 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MBD3O95983 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MBD3O95983 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MBD3O95983 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MBD3O95983 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MBD3O95983 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MBD3O95983 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MBD3O95983 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MBD3O95983 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MBD3O95983 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MBD3O95983 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MBD3O95983 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MBD3O95983 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MBD3O95983 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MBD3O95983 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MBD3O95983 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MBD3O95983 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MBD3O95983 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MBD3O95983 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MBD3O95983 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MBD3O95983 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MBD3O95983 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MBD3O95983 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MBD3O95983 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MBD3O95983 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MBD3O95983 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MBD3O95983 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MBD3O95983 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MBD3O95983 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MBD3O95983 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MBD3O95983 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MBD3O95983 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MBD3O95983 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MBD3O95983 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MBD3O95983 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MBD3O95983 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MBD3O95983 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MBD3O95983 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MBD3O95983 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MBD3O95983 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MBD3O95983 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MBD3O95983 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MBD3O95983 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD3O95983 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD3O95983 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD3O95983 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD3O95983 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD3O95983 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD3O95983 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD3O95983 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD3O95983 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD3O95983 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD3O95983 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD3O95983 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD3O95983 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD3O95983 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD3O95983 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD3O95983 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD3O95983 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD3O95983 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD3O95983 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms