Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCTN3O75935 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms